เซลล์ธรรมชาติประกอบด้วย 46 โครโมโซมซึ่งโครโมโซมถูกรวมเข้าด้วยกัน ในที่สุดเซลล์ของร่างกายมีโครโมโซม 23 คู่ ในกลุ่มอาการดาวน์มีโครโมโซม 3 คู่ในคู่ 21 แทนโครโมโซม กลุ่มอาการดาวน์ผลิตโครโมโซม 95% เนื่องจากการขาดการแบ่งตัวในส่วนที่เท่ากันของไข่หรืออสุจิและทำให้โครโมโซมทั้งหมดคือ 47 โครโมโซมและใน 4% ของดาวน์ซินโดรมส่งผลให้เกิดโรคของการเปลี่ยนแปลงที่โครโมโซมย้ายจากคู่หนึ่งไปยังสามี หมายเลข 21
ดังนั้นจำนวนโครโมโซมทั้งหมดในเซลล์คือ 46 โครโมโซมและ 1% ของเด็กที่เป็นสาเหตุของโรค Downs คือการเปลี่ยนสีที่เซลล์บางเซลล์มีโครโมโซมธรรมชาติในคู่ที่ 21 จึงมีโครโมโซมทั้งหมด 46 เซลล์และบางเซลล์ มีโครโมโซม 3 อันคู่ที่ 21 จึงมีจำนวนทั้งสิ้น 47 โครโมโซมและความแตกต่างเกิดขึ้นเนื่องจากการแบ่งที่ไม่เป็นธรรมในช่วงการพัฒนาของทารกในครรภ์